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Autor: =Masanori, Arita
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Publicación seriada
Referencias AnalíticasReferencias Analíticas
Autor: Masanori, Arita
Título: Comma-Free Design for DNA Words
Páginas/Colación: pp.99-100.; 28cm.; il.
Communications of the ACM Vol. 47, no. 5 May 2004
Información de existenciaInformación de existencia

Resumen
Since DNA sequences have no commas or spaces, frame synchronization, a property referred to as comma-freeness, is ideal for DNA code words. While no systematic construction has been developed for a binary comma-free, error-correcting code of large minimum distance, for the quaternary DNA sequence there exists a simple construction, the template method. Since annealing is essentially a physical, probabilistic process, unwanted annealing and subsequent DNA editing can occur at a stretch of completely matching DNA base-pairs. To avoid this, no subword of length-7 or 8 should appear in the designed words and their concatenations more than once. In the template method, this constraint is separately assigned to the template and the error-correcting code words.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

UCLA - Biblioteca de Ciencias y Tecnologia Felix Morales Bueno

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